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Raw file Scan number Scan index Sequence Length Missed cleavages Modifications Variable mods Oxidation (M) Probabilities Oxidation (M) Score Diffs Acetyl (Protein N-term) Oxidation (M) Proteins Gene Names Protein Names Charge Mass analyzer Type Scan event number Isotope index m/z Mass Mass error [ppm] Mass error [Da] Simple mass error [ppm] Retention time PEP Score Delta score Score diff Localization prob Combinatorics PIF Fraction of total spectrum Base peak fraction Precursor Full ScanNumber Precursor Intensity Precursor Apex Fraction Precursor Apex Offset Precursor Apex Offset Time Matches Intensities Mass Deviations [Da] Mass Deviations [ppm] Masses Number of Matches Intensity coverage Peak coverage Neutral loss level ETD identification type Reverse All scores All sequences All modified sequences id Protein group IDs Peptide ID Mod. peptide ID Evidence ID Oxidation (M) site IDs
20181231_MARS14_pool_high_F7 54716 46560 25 0 Acetyl (Protein N-term) Acetyl@N-term 1 0 O75822-2;O75822-3;O75822 EIF3J Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J 3 FTMS MULTI-MSMS 10 2 836.37009 2506.0884 -1.2592 -0.0010531 0.13181726 92.99 0.0012614 42.612 40.205 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y7;y8;y10;y4-NH3;b2;b3;b4;b5;b6 40163.1;95360.7;15108.8;40514.5;26327.7;8782.2;34359.3;47722;97897.5;110195.4;95524.4;34359.3 0.000230634813505048;0.000905070330702529;0.00258890081511254;0.000514524718937537;0.00871905738017631;-7.49172302221268E-05;0.000776017827547548;-0.000184925035057404;0.000747295773862788;-0.000348672125028315;-0.000370928034158169;0.000776017827433861 1.31701974219941;2.43797064008482;5.32405902522086;0.642024656140269;9.1927622262581;-0.0660329780940794;1.65377684026883;-0.999096566210468;2.91766032623191;-1.06573249560221;-0.931503044014543;1.65377684002655 175.118721546186;371.239224878869;486.264484080385;801.409593878781;948.46980326232;1134.54265405673;469.239747861872;185.092253653535;256.128435220526;327.166644976225;398.203781019934;469.239747861872 12 0.673174490985224 0.366666666666667 None Unknown 42.6124955828197;2.40778101284533;2.21243628384252 AAAAAAAGDSDSWDADAFSVEDPVR;DRAAAAESGASDEADSDSIEWTPR;DDDYLRDLNGSVEMRYDQMR _(ac)AAAAAAAGDSDSWDADAFSVEDPVR_;_DRAAAAESGASDEADSDSIEWTPR_;_DDDYLRDLNGSVEM(ox)RYDQMR_ 0 619 0 0 0
20181221_MARS14_pool_high_F23 28396 21973 14 0 Acetyl (Protein N-term) Acetyl@N-term 1 0 P28482-2;P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 2 FTMS MULTI-MSMS 3 0 642.82189 1283.6292 -0.57824 -0.00037171 0.95606557 53.393 0.00027516 87.298 76.775 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;b2;b3;b4;b5;b6;b7 44622;13483.4;75258.8;9752.1;121624.7;69759.6;53609.8;19184.8;83525.2;158994.4;157088.3;93136.2;17343.2;8897.2 0.0008298587625859;0.00579489625874885;0.0013658737593687;0.00709134730493588;0.00450235799451093;-0.000770215812053721;0.00532468799485741;0.00955977644366612;0.000186504558570277;0.000804652660406191;0.000911779394527912;0.000487118519117757;0.00413842643257567;2.95711287208178E-05 4.73885141972265;9.17905342331273;1.98429148428151;9.33840350842267;5.51490067035909;-0.867906369795242;5.55539144773378;9.28579867090962;1.00763229769649;3.14159901810873;2.78690667673328;1.22329217344876;8.81949175483927;0.0561908917592901 175.118122322237;631.317412755341;688.343305501441;759.374693815695;816.398746528606;887.441132890212;958.472151774205;1029.50503047356;185.091882223941;256.12837786364;327.165384524705;398.202922973381;469.236385453267;526.261958032171 14 0.427143808839894 0.197183098591549 None Unknown 87.2980519351928;10.52345256087;8.95832254655138 AAAAAAGAGPEMVR;TPQEWAPQTAR;TGQRKAYMEGK _(ac)AAAAAAGAGPEMVR_;_TPQEWAPQTAR_;_TGQRKAYM(ox)EGK_ 1 1129 1 1 1
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